Comptabilité freelance : le guide complet pour 2026

La comptabilité est souvent la bête noire des freelances. Pourtant, bien gérée, elle ne prend que quelques heures par mois et vous évite des ennuis avec l’administration. Ce guide couvre tout ce que vous devez savoir en 2026 : statuts, obligations, outils et bonnes pratiques.

Les statuts juridiques du freelance

Micro-entreprise (auto-entrepreneur)

C’est le statut le plus simple et le plus utilisé par les freelances débutants.

Avantages :

Création gratuite en 10 minutes
Comptabilité ultra-simplifiée (livre des recettes)
Cotisations sociales proportionnelles au CA (21,1% pour les services)
Franchise de TVA jusqu’à 36 800€ de CA
Pas de bilan comptable obligatoire

Inconvénients :

Plafond de CA : 77 700€/an (services) ou 188 700€/an (vente)
Pas de déduction de charges (forfait uniquement)
Responsabilité illimitée sur le patrimoine personnel
Image moins « professionnelle » pour certains clients

Idéal pour : les freelances qui démarrent, avec un CA inférieur à 77 700€/an.

Entreprise individuelle (EI)

Depuis 2022, le statut d’entreprise individuelle offre automatiquement la séparation des patrimoines.

Avantages :

Pas de plafond de CA
Déduction des charges réelles
Séparation patrimoine pro/perso automatique
Possibilité d’opter pour l’IS

Inconvénients :

Comptabilité plus lourde (bilan, compte de résultat)
Cotisations sociales sur les bénéfices
Expert-comptable recommandé

SASU / EURL

Pour les freelances avec un CA important ou des besoins spécifiques.

EURL : version unipersonnelle de la SARL, régime TNS (cotisations ~45%) SASU : version unipersonnelle de la SAS, régime salarié (cotisations ~65% mais meilleure protection sociale)

Idéal pour : CA > 80 000€/an, besoin de crédibilité, optimisation fiscale.

Les obligations comptables par statut

Micro-entreprise

Obligation	Détail	Fréquence
Livre des recettes	Toutes les recettes encaissées	En continu
Registre des achats	Si activité de vente	En continu
Factures conformes	Mentions obligatoires	À chaque vente
Déclaration CA	URSSAF	Mensuelle ou trimestrielle
Déclaration IR	Revenus BIC/BNC	Annuelle
Déclaration TVA	Si dépassement du seuil	Mensuelle/trimestrielle/annuelle
CFE	Cotisation foncière des entreprises	Annuelle

Pour gérer ces obligations facilement, un logiciel comme Indy automatise la majorité des tâches : factures, livre des recettes, déclaration URSSAF et même la déclaration d’impôts.

EI / EURL / SASU

Obligation	Détail
Bilan comptable	Actif/passif au 31/12
Compte de résultat	Charges et produits de l’exercice
Grand livre	Toutes les écritures comptables
Liasse fiscale	Déclarations fiscales annuelles
TVA	Déclarations périodiques
PV d’AG	EURL/SASU uniquement

Un expert-comptable est fortement recommandé. Indy propose un forfait comptabilité avec expert-comptable dédié à partir de 59€/mois.

La facturation : règles et bonnes pratiques

Mentions obligatoires sur une facture

Depuis 2024, les règles de facturation se sont durcies. Voici les mentions obligatoires :

Identité du vendeur : nom/raison sociale, adresse, SIREN/SIRET
Identité de l’acheteur : nom/raison sociale, adresse
Numéro de facture : séquentiel, sans rupture (F-2026-001, F-2026-002…)
Date d’émission de la facture
Date de la prestation ou de la livraison
Désignation des produits/services
Quantité et prix unitaire HT
Montant total HT et TTC
Taux de TVA applicable (ou mention « TVA non applicable, art. 293 B du CGI » en franchise)
Conditions de paiement : délai, pénalités de retard, indemnité forfaitaire de recouvrement (40€)
Numéro de TVA intracommunautaire (si assujetti)
Mention « Membre d’une association agréée » (si applicable)

Pour ne rien oublier, consultez notre article détaillé sur les mentions obligatoires sur une facture freelance.

Automatiser sa facturation

Un bon logiciel de facturation vous fait gagner des heures chaque mois :

Indy : facturation + comptabilité complète, plan gratuit disponible
Tiime : facturation gratuite illimitée + compte pro

Les deux outils génèrent des factures conformes avec toutes les mentions obligatoires et automatisent le suivi des paiements.

La TVA pour les freelances

Franchise en base de TVA

En micro-entreprise, vous êtes exonéré de TVA tant que votre CA ne dépasse pas :

36 800€ pour les prestations de services
91 900€ pour la vente de marchandises

En dessous de ces seuils, vous ne facturez pas de TVA et ne la récupérez pas sur vos achats. Vous ajoutez la mention : « TVA non applicable, art. 293 B du CGI ».

Dépassement du seuil

Si vous dépassez le seuil :

Vous devez demander un numéro de TVA intracommunautaire
Vous facturez la TVA à vos clients (20% en général)
Vous déclarez et reversez la TVA à l’État
Vous pouvez récupérer la TVA sur vos achats professionnels

TVA et facturation internationale

Client en France : TVA française (20%)
Client en UE (B2B) : autoliquidation (pas de TVA facturée)
Client hors UE : pas de TVA (exportation de services)

Indy gère automatiquement les règles de TVA selon la localisation du client.

Les déclarations obligatoires

Déclaration URSSAF (micro-entreprise)

Vous déclarez votre chiffre d’affaires sur autoentrepreneur.urssaf.fr :

Mensuelle : déclaration chaque mois (choix à la création)
Trimestrielle : déclaration tous les 3 mois (par défaut)

Les cotisations sont calculées automatiquement :

21,1% du CA pour les prestations de services (BNC)
21,2% pour les activités commerciales (BIC)
12,3% pour la vente de marchandises

Pour un guide étape par étape, consultez notre article Déclaration URSSAF auto-entrepreneur.

Déclaration d’impôts

En micro-entreprise, vous avez deux options :

Versement libératoire : 1,7% (BNC) ou 1% (BIC) prélevé chaque mois/trimestre avec les cotisations
Imposition classique : abattement forfaitaire de 34% (BNC) ou 50% (BIC) sur le CA, intégré à votre déclaration d’IR

Les outils de comptabilité recommandés

Notre top 3

Outil	Note	Prix	Idéal pour
Indy	9.0/10	Gratuit puis 12€/mois	Micro et EI/SASU/EURL
Tiime	8.8/10	Gratuit (factures)	Facturation gratuite
Pennylane	7.5/10	14€/mois	Collaboration expert-comptable

Pour un comparatif détaillé, consultez notre classement des meilleurs logiciels de comptabilité freelance.

Indy — Notre recommandation n°1

Indy est le logiciel le plus complet pour les freelances :

Facturation : devis, factures, avoirs, relances automatiques
Comptabilité automatique : synchronisation bancaire, catégorisation IA
Déclarations : URSSAF, TVA, 2042-C-Pro pré-remplies
Expert-comptable : forfait avec EC dédié dès 59€/mois
Plan gratuit : facturation et livre des recettes

Lire notre avis complet sur Indy.

Tiime — La facturation gratuite

Tiime est idéal si vous cherchez un outil de facturation gratuit et illimité :

Factures illimitées gratuitement
Compte pro : carte Visa Business + cashback
Comptabilité : synchronisation bancaire et catégorisation
Interface : très simple et intuitive

Lire notre avis complet sur Tiime.

Automatiser sa comptabilité avec Make.com

Connectez vos outils comptables à Make.com pour automatiser les tâches répétitives :

Scénarios utiles

1. Facture envoyée → suivi automatique

Client facturé → ajout dans un Google Sheet de suivi
Échéance dépassée → notification Slack + relance automatique
Paiement reçu → mise à jour du statut + archivage

2. Nouveau paiement reçu → écriture comptable

Paiement détecté sur le compte → catégorisation automatique
Rapport hebdomadaire → email récapitulatif des encaissements

3. Fin de mois → préparation déclaration

Calcul automatique du CA mensuel
Rappel de déclaration URSSAF
Génération d’un récapitulatif pour l’expert-comptable

Pour des scénarios détaillés, consultez notre article Automatiser sa comptabilité freelance avec Make.com et notre guide de l’automatisation freelance.

Les erreurs comptables fréquentes

Erreur 1 : Mélanger comptes perso et pro

Ouvrez un compte bancaire dédié (obligatoire si CA > 10 000€ pendant 2 ans consécutifs). Tiime propose un compte pro gratuit avec carte Visa Business.

Erreur 2 : Ne pas facturer correctement

Une facture non conforme peut être refusée par l’administration. Utilisez un logiciel certifié comme Indy ou Tiime.

Erreur 3 : Oublier de déclarer son CA

Même si votre CA est de 0€, vous devez déclarer. Le non-déclaration entraîne des pénalités.

Erreur 4 : Ne pas provisionner les cotisations et impôts

Mettez de côté 25-30% de votre CA dès réception des paiements pour couvrir les cotisations sociales et l’impôt sur le revenu.

Erreur 5 : Ignorer la TVA

Surveillez votre CA par rapport aux seuils de franchise. Le dépassement non anticipé peut créer des problèmes de trésorerie.

Calendrier comptable du freelance

Mois	Action
Chaque mois/trimestre	Déclaration URSSAF
Janvier	Déclaration CFE (si changement de situation)
Avril-Juin	Déclaration d’impôts (2042 + 2042-C-Pro)
Décembre	Vérification seuils TVA et micro-entreprise
En continu	Facturation, suivi paiements, livre des recettes

FAQ

Faut-il un expert-comptable en micro-entreprise ?

Non, ce n’est pas obligatoire. La comptabilité en micro-entreprise est suffisamment simple pour être gérée avec un logiciel comme Indy. Un expert-comptable devient utile si vous passez en EI, EURL ou SASU.

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité pour freelance ?

Indy est notre recommandation n°1 pour sa complétude (facturation + comptabilité + déclarations). Tiime est idéal si vous cherchez uniquement la facturation gratuite. Consultez notre comparatif complet.

Combien mettre de côté pour les charges ?

En micro-entreprise, prévoyez 25-30% de votre CA : environ 21% pour les cotisations URSSAF + l’impôt sur le revenu (variable selon votre tranche).

Peut-on être freelance et salarié ?

Oui, le cumul emploi-salarié / micro-entreprise est tout à fait possible, sous réserve de vérifier votre clause de non-concurrence et d’exclusivité dans votre contrat de travail.

Conclusion

La comptabilité freelance n’est pas compliquée — elle demande juste de la rigueur et les bons outils. Avec Indy pour la comptabilité et la facturation, Tiime pour le compte pro, et Make.com pour automatiser le suivi, vous gérez vos finances en quelques heures par mois.

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